莲花生大士心咒念一次的功德，若比喻为有一个形状的的实体话，可以装满整个南瞻部洲;能够听到、看到或思惟这个咒语的所有众生，都可以和持明佛父佛母同处。

《西藏生死书》：佛经中讲，修莲师法，有无量无边不可思议的功德，简单言之，能具足息增怀诛，普度一切众生之大威德。且能了知世间出世间一切诸法，显密圆通，坚固戒律，顿开智慧，辩才无碍。其余如祛病、免难、长寿、衣食具足，息灭一切地方人风空所生诸灾，摧灭妖魔，能令一切鬼无不恭敬听命等等。

“据说，嗡阿吽班杂咕噜叭嘛悉地吽，这十二个字母带着佛陀说法十二部(八万四千法门的精华)的整个加持，因此念金刚上师咒就等于念颂或修持佛陀全部教法的加持。十二部教法是解药，可以让我们从“十二因缘”解脱出来，而使得我们轮回六道的正是这十二因缘：无明、行、识、名色、六入、触、受、爱、取、有、生、老死。这个十二因缘是轮回的机制，让轮回不断进行。透过念金刚上师咒的十二个字母，十二因缘就被净化，你就可以完全驱除和净化烦恼，从轮回中获得解脱。

虽然我们无法看到莲花生大士本人，但他的智慧心已经显现在咒的形式上，这十二个字母事实上是他的智慧心的发射，具有他的加持。金刚上师咒是莲花生大士的声音显现。因此当你以念颂十二个字母来启请他时，你将获得巨大的加持和功德。在当前的困难时代里，我们所能启请与皈依的，以莲花生大士最殊胜，所以，金刚上师咒最适合这个时代。”

下面详解莲花生大士心咒语的功德

嗡阿吽—是身口意最殊胜的精华

班渣——是金刚部最殊胜的精华

咕噜——是宝生部最殊胜的精华

贝玛——是莲花部最殊胜的精华

悉地——是事业部(羯磨部)最殊胜的精华

吽———是佛部最殊胜的精华

嗡———是法身不变圆满

阿———是五方佛报身圆满

吽———是化身莲师尊前圆满

班渣——是嘿噜嘎(饮血尊)本尊坛城圆满

咕噜——是上师持明本尊坛城圆满

贝玛——是空行本尊坛城圆满

悉地——是所有财神及岩藏取者的命脉

吽———是所有护法的命脉

嗡阿吽—是三传承(密意/持明/口耳)命脉

班渣——是经律二藏的命脉

咕噜——是论藏和事续部的命脉

贝玛——是行续部和瑜伽续部的命脉

悉地——是玛哈瑜伽的命脉

吽———是阿努瑜伽和阿底瑜伽的命脉

嗡阿吽—可以消除三世一切的罪障

班渣——可以消除瞋恨心所造的一切罪障

咕噜——可以消除傲慢心所造的一切罪障

贝玛——可以消除贪心所造的一切罪障

悉地——可以消除嫉妒所造的一切罪障

吽———可以消除烦恼所造的一切罪障

嗡阿吽—可以获得法报化三身

班渣——可获得大圆镜智(东方不动佛的智能)

咕噜——可获得平等性智(南方宝生佛的智能)

贝玛——可获妙观察智(西方阿弥陀佛的智能)

悉地——可得成所作智(北方不空成就佛的智能)

吽———可获得五种本智任运成就

嗡阿吽—可以勾召天、魔、人

班渣——可以去除食香及火神的障碍

咕噜——可以去除阎魔及罗剎的障碍

贝玛——可以去除水神及风主的障碍

悉地——可以去除夜*及自在天神的障碍

吽———可去除罗喉星耀(致使癫痫)及地主的障碍

嗡阿吽—可以成办六度波罗密

班渣——可以成办一切息灾的事业

咕噜——可以成办一切增益的事业

贝玛——可以成办一切怀爱的事业

悉地——可以成办所有的事业

吽———可以成办一切诛伏的事业

嗡阿吽—可以去除外道的诅咒

班渣——可以去除本智天神(耶喜啦)的诅咒

咕噜——可以去除天龙八部的诅咒

贝玛——可以去除世间天的诅咒

悉地——可以去除龙和地主的诅咒

吽———可以去除天、人、魔的诅咒

嗡阿吽—可以摧灭五毒魔军

班渣——可以摧灭瞋恨的魔军

咕噜——可以摧灭傲慢的魔军

贝玛——可以摧灭贪的魔军

悉地——可以摧灭嫉妒的魔军

吽———可以摧灭天、人、魔三种魔军

嗡阿吽—可获得身、口、意的成就

班渣——可以获得本尊寂忿的成就

咕噜——可以获得持明无上的成就

贝玛——可以获得空行的成就

悉地——可以获得共与不共的成就

吽———可以获得如愿的成就

嗡阿吽—可以到达普贤王如来本初净土

班渣——可以到达东方不动佛妙喜世界净土

咕噜——可以到达南方宝生佛众宝庄严净土

贝玛——可到达西方阿弥陀佛极乐世界净土

悉地——生北方不空成就佛无上妙行成就净土

吽———可以到达中央毗卢遮那佛密严净土

嗡阿吽—可以获得三身持明果位

班渣——可以获得此地持明果位

咕噜——可以获得寿命自在持明果位

贝玛——可以获得大手印持明果位

悉地——可以获得任运成就持明果位

吽———可以获得成熟持明果位